Вам никак не обойтись без фиксирования суммы доплаты на документальном уровне. Ведь мало ли, а вдруг в дальнейшем что-то да и пойдет не так? Вдруг придется оспаривать сделку и т. п.? Очень важно правильно оформить обмен квартир юридически, чтобы застраховаться от всевозможных рисков. В общем попробуйте здесь получить консультацию по своему вопросу.